现实世界。
神崎旧宅的二楼中，有一个房间，是神崎夫妇生前经常将他们的儿女囚禁其中的房间。
当初，年仅七岁的神崎优衣，就是在被他们关入那个房间中的时候，死去的。
之后，镜中世界的神崎优衣，在神崎士郎的同意下，来到了现实之中。
神崎优衣“复活”了。
但是，来自镜中世界的神崎优衣，却只能在现实世界里活到二十岁。
于是，为了让神崎优衣能够在二十岁生日那天获得一份继续存续下去的“新的生命”，神崎士郎不顾一切的开发出了镜世界骑士系统，开启了充满欲望的13骑士战争。
其目的，就是为了在最终胜利之后，收获到那份“新的生命”。
然而，在执行计划的过程中，神崎士郎却遭遇到了一次又一次的失败。
而每一次失败，神崎士郎都会重置时间，重头再来。
就这样，仿若没有终局一般的假面骑士龙骑的故事，就此展开。
然后，该说是宿命吗？
在原本的历史中，神崎士郎最后一次重置时间，接受现实，选择与神崎优衣在当年一同死去的地方，同样是那个房间。
那是一切的开始，亦是一切的结束。
现在，还是以那个房间作为起点，龙骑的故事再一次开始了。
神崎士郎复活，与手持异类龙骑表的斯沃鲁兹相遇……
异类龙骑事件就此展开。
13骑士战争再启。
不仅当年的骑士们重新被卷入战争之中。
社会上，毫无规律可言的离奇失踪案也开始重新出现。
其中一件，恰好就引起了常磐庄吾的注意。
因为那起失踪案的受害者，是常磐顺一郎的客户。
周日假期，代替常磐顺一郎前去给客户送还电视机的常磐庄吾，在走到客户房门外的时候，突然听到从屋内传出了一道惊恐的尖叫声。
“喂！发生了什么？”
“你没事吧？”
喊声没有得到丝毫回应的常磐庄吾，一脚踹开了房门，进入其中。
可当他进去时，却发现，屋内，除了梳妆镜前有一些挣扎的痕迹外，一个人都没有。
显然，这起失踪案，并不简单。
由此，常磐庄吾开始深入调查。
在调查的过程中，被镜世界怪物盯上的常磐庄吾，遭遇了镜怪物的袭击。
可遭遇了镜怪物袭击的常磐庄吾，却不惊反喜。
他觉得，他可能找到了那一起起离奇失踪案的真相。
为了验证自己的想法，常磐庄吾任由镜怪物将他拉入进了镜中世界。
可还不等他多做什么，他就遇到了被那只镜怪物引来的骑士――妖翠。