虽说无毒不丈夫，但朱温之知恩不报，甚或恩将仇报，实为后世所不齿。884年，黄巢军在向东撤退途中进入朱温辖区。5月，巢军已攻占了离汴州不到五十公里的尉氏县，骑兵先锋也已经抵达汴州东南郊的繁台。朱温眼瞅着破袭无望，便向河东节度使李克用求救。李克用手中有一支因着黑衣而被称为乌鸦军的沙陀兵团，是当时相当能打的部队。
接到求援信后，李克用二话没说，带上沙陀兵团立刻从许州出发。从许州到汴州，一百多公里，李克用快马加鞭，及时赶到，并击败巢军。朱温因此得救，于是在上源驿这个地方设宴劳军。筵席上，仅因“克用乘醉任气”，朱温便“命甲士围而攻之”。
中国人讲究滴水之恩涌泉相报，更何况救命之恩。即便李克用酒后说了几句醉话，还不至于就此便要动手杀人吧。赶来救人的李克用怎么也不会想到白天还在沙场上拼尽气力，晚上却要被自己所救的这个人痛下杀手。不过好在苍天有眼，朱温采用火攻，而适逢大雨如注，李克用因此得以“踰垣遁去”，只可惜了几百亲兵全部死得不明不白。
黄巢死后，余党秦宗权盘踞在蔡州继续肆虐。蔡州兵团被称为骡子兵团，在当时也是比较能打的部队。据说，这个兵团打仗从不带粮草，军用所需全部就地抢掠，随军带上食盐和死尸，没有东西吃就直接割肉烹食。汴州与蔡州相邻，躲又躲不了，这样的蔡州兵打又打不过，朱温只有恨的牙根痒痒。
887年，朱温再也受不了秦宗权的袭扰，联合郓州的朱瑄、兖州的朱瑾两兄弟，借助其精兵三万，终于合力打败了蔡州主力。解决了秦宗权这块心病后，朱温马上就瞄上了朱家兄弟的地盘。于是，朱温派了很多人先到朱家兄弟那里诈叛，然后又以追讨叛徒为名入侵朱家兄弟的地界。后来，朱瑄战死，朱瑾败走，朱温趁机霸占了拜把子兄弟朱瑾的妻子。只是薛居正《旧五代史》将这段历史记载为朱家兄弟羡慕朱温的部队能打，所以在边界上“悬金帛以诱之”，且“来词不逊”，朱温迫不得已才“侵曹伐濮，以惩其奸”。幸赖欧阳修以春秋之笔，在《新五代史》中改作“（温）诬其诱汴亡卒以东，乃发兵攻之”，以一“诬”字还其本原。
随着地盘的扩充和实力的增加，朱温加快了篡唐夺位的进程。904年，朱温以迎取皇帝入住洛阳新宫的名义软禁了唐昭宗。唐昭宗为自保向天下发出告急诏书，朱温立刻命养子朱友恭和部将氏叔琮杀掉唐昭宗。朱、氏二人按朱温指示，夜闯禁宫，杀了皇帝。朱温诡计得逞，但为堵天下人之口，竟以“非己志”为借口，奏请新立小皇帝唐哀宗先将朱、氏二人贬官，后又赐死。朱友恭临死前大骂“卖我塞天下谤！”
906年，朱温已急不可待的想要登基改元，故而指示宰相柳璨、枢密使蒋玄晖等敦促小皇帝赶紧禅位。柳、蒋二人拟遵古制按程序走流程，先封个大诸侯国，再来个九锡之礼，朱温嫌慢即“王怒，不受。”柳、蒋二人马不停蹄赶到洛阳，经过紧锣密鼓的操办，禅位之事终于搞定，但就在此时，朱温却“遣人告枢密使蒋玄晖与何太后私通”，将柳璨、蒋玄晖等人一股脑全杀了。柳璨本为唐相，为自保而献媚朱温，最终却因此被杀，临死只有自己骂自己“负国贼该死！”