胡子睿知道，方有度此疏也道出想在辽东养十一万兵，确实是很难的一件事！毕自严时任户部右侍郎，兼管辽东督饷事务，方有度引用他的上疏是比较有权威性的；当时除辽东以外，蓟镇、保定、宣府、大同、山西、延綏、宁夏、甘肃其他几个重镇加起来饷银才三百四十余万有奇；而因为供应辽东征收的新饷就有四百八十五万有奇。
四百八十五万两银子的辽饷，虽然对于大明王朝来说是个天文数字，然而，这还不是最终大明百姓要负担的金额，因为这只是征收的饷银，全部用于养兵，还存在一个巨大的缺口，即一百六十二万两。
以上所说的还只是全部征收上来的理论情况，实际上两京十三省在征收税赋时，都会有不会程度的留用、损耗的情况发生，这些缺口最终还是由百姓来填补；年复一年的加税有如套在百姓脖子上的隐形绞索，随着绞索越来越紧，高迎祥、李自成、张献忠出现了，越来越多的百姓加入了他们的队伍，队伍越来越壮大那根绞索最终套在了前世崇祯皇帝的脖子上，胡子睿想到这里，不由地摸了摸自己的脖子，不禁一阵后怕。
督饷御史王祚昌也上疏言：“今榆关之兵以十四万计矣，于中岂无占役逃亡。马以七万计矣，于中岂无倒毙虚报。占役虚报不清，逃亡倒毙不补……清一二万虚冒之兵马，即可省国家数万金钱矣。”
孙承宗看到这些上疏后很气愤，上陈守御策疏，言：“拒敌门庭之中，与拒诸门庭外，势既变。我促敌二百里外，敌促我二百里中，势又变。盖广宁，我远而敌近；宁远，我近而敌远。我不进逼敌，敌将进而逼我。今日即不能恢辽左，而宁远、觉华终不可弃。请敕廷臣杂议主、客之兵可否久戍，本折之饷可否久输，关外之土地人民可否捐弃，屯筑战守可否兴举，再察敌人情形果否坐待可以消灭。臣不敢为百年久计，只计及五年间究竟何如。倘臣言不当，立斥臣以定大计，无纡回不决，使全躯保妻子之臣附合众喙，以杀臣一身而误天下也。”
天启皇帝将孙承宗等人的奏折交给大臣们朝议，吏部尚书崔景荣支持孙承宗，于是下诏勉留，而以精简将官、淘汰弱兵、清理粮饷三件事责孙承宗。孙承宗得到诏令后，于是遣诸将分戍锦州、大小凌河、松、杏、右屯诸要害，拓地复二百里，罢免大将王世钦、尤世禄，副将李秉诚、孙谏。
平辽总兵官马世龙也向天启皇帝奏称，关门兵马数多，疑端易起。仰恳差科道阅查，以明虚实，以服群心。于是科道参加盘点后，由兵部尚书大学士孙承宗向天启皇帝上报《汰过关门兵马总数》．原额官兵一十三万四千四百三十三员名，今共汰一万七千三百四十七员名，见在官兵一十一万七千八十六员名．原额马、骡、驴、驼、牛共五万九千五百一匹头只，今汰过五千六百四十九匹，见在五万三千八百五十二匹头只，可省度支六十八万。然而，言官仍然弹劾马世龙不已。
此时，魏忠贤已经盗取朝堂权柄。因为孙承宗功劳很高，他欲拉拢孙承宗，令刘应坤等人借往辽东视查时申明此意。孙承宗不与刘应坤等人交一言，魏忠贤于是心中不快。当时，魏忠贤逐杨涟、星、高攀龙等，孙承宗正好西巡蓟镇、昌平等地，听闻此事后便要上疏为他们求情，转念一想此刻上疏，天启皇帝未必能亲自阅览，又想起往日在讲筵之时，每次奏对都能得到回应，于是请以贺圣寿为名，入朝面奏机宜，欲论魏忠贤之罪。