明军的阵型是以炮舰各排列成一条长长的直线纵队，外围小船冲杀，中间大船火力轰击。王新宇和刘国轩乘坐的帅船，也就是旗舰，并非是躲在安全的后方，而是在队列中冲杀。而清军的施琅座舰，却是躲在安全的后方。
这个是当年东西方水战的区别之处，西方海战，旗舰也是跟着冲锋陷阵；东方水战，旗舰躲在后面指挥。
王新宇的旗舰从一艘清军的大福船边上通过，炮门中依次喷出火光，对方的那艘船被打得满目疮痍。尽管对手也用炮火反击，可是当年的东方战船仍然是以接舷战为主，在火力上同明军水师根本就不是一个档次的。
敌我两艘船从相距一百五十步外反方向擦了过去，也就在旗舰对清军那艘五百料的大福船猛烈炮击的时候，一艘明军的杆雷艇从王新宇的旗舰后面突然冲出，冲向清军大船。
双方距离实在太近了，不过一百五十步，杆雷艇只要半分钟的时间就能冲到。尽管清军战船上的佛郎机炮装填速度快，可是这艘杆雷艇的移动速度相当快，大福船上的清军炮手在慌乱之中没有换上霰弹，误装填了实心炮弹。
两门八百斤佛郎机炮喷出火舌，两发炮弹向冲来的杆雷艇飞去。不过炮弹均未击中，落在湖水中，腾起了两道冲天水柱。
杆雷艇上的倭国足轻桨手拼了命的划桨，杆雷艇犹如一条水面疾飞的龙舟，直冲清军的大福船。
清军炮手再次装填，换上了装填了霰弹的子铳，但是已经来不及了，明军战船上一排炮弹击中了清军大福船，一发炮弹击穿了船上的垛口之后，炮弹直接击穿后面的炮位，佛郎机炮被打得翻在甲板上，破碎的木片四射，几名清军炮手倒下。另外一发炮弹击中垛口，成排的碎木片好像弹片一样迸溅到甲板上，打得清兵鬼哭狼嚎。
清军大福船的火力被压制，还没等到后面的清军炮手上来操起火炮开火，杆雷艇一下就冲到了大福船跟前。
“轰”这艘五百料的大福船水线下破开一个大洞，开始进水下沉。
双方大船交手的时刻，不时有明军的杆雷艇从己方大船后面突然杀出，用船头的撑杆水雷向清军的大船发起攻击。
“轰，轰轰”湖面上不时腾起冲天水柱，遭到明军杆雷艇攻击的清军大船一艘接一艘被炸开大洞，燃起了熊熊烈火，冒着滚滚浓烟，在火光中开始下沉。
相比起清军的火攻船来，杆雷艇因为不需要装载大量的柴草，自身也不需要武器，因此船上桨手比例高，船小灵活，速度快，防护能力也不差。
清军的火攻船就没有那么快了，使用风帆的火攻船即将靠近明军大船的时候，往往八磅炮射出的链弹打落了风帆，速度就慢了下来，之后明军用小船和快蟹船去拦截，清军火攻船很难找到机会得手。
在混战之中，明军只有一艘西式内河炮舰被一艘清军的火攻船撞上，那艘内河炮舰起火，火焰很快蔓延到船上，船上的明军军官不得不下令放弃战舰。